在《巴比伦5号 第三季》中，地球政府与心灵部队发掘出太阳系内埋藏的暗影飞船，并开始利用其先进技术壮大自身力量。克拉克总统领导下的政权逐步走向排外与极权，更借军事冲突为由实施全面戒严，激化了火星殖民地长期以来的不满，最终引爆独立战争。与此同时，巴比伦5号空间站也宣布脱离地球独立，多个外围殖民地相继响应。地球联盟试图以武力夺回这一战略要地，却在进攻中遭到挫败——因明巴利人已与空间站结为同盟，共同面对日益逼近的暗影威胁。随着局势升级，观众可在多个平台免费在线观看这场星际纷争的激烈展开。