神秘飞行体“灾”突然降临，其压倒性的战斗力令人类所有航空力量束手无策。为与之抗衡，人类开发出名为“子体”的特殊兵器——通过对现有战机进行超规格改造，实现前所未有的高机动性。而操控这些战机的核心“阿尼玛”，竟呈现出少女的形态。因“灾”而失去飞行员的少年鸣谷慧，在某日邂逅了鲜红夺目的瑞典制战机及其人形操纵系统——格里芬。这位身为人类最终兵器的少女却有着不稳定的战斗表现，怀揣天空梦想的少年与摇摆不定的机甲少女，共同谱写出一段波澜壮阔的空中史诗。现在，《飞翔吧！